原住民聚落屬南島語族,早在西方人與漢人來前就已在台定居。以部落聯盟方式彼此戰鬥與貿易。荷人依當地風俗習慣與信仰,將當時大員原住民稱西拉雅族。其下又分四個較強盛部落-麻豆社、蕭壠社、目加溜灣社、新港社,合稱四大社。
漢人聚落-普羅民遮城荷蘭人在郭懷一事件後,於1653年建立的另一座碉堡,用來治理附近的漢人。後來在清領時期因戰爭及地震而毀壞。十九世紀後,漢人在荷蘭城堡的遺址之上再陸續興建儒、道教廟祠。因為位在赤崁地區,命名為赤崁樓。
海上貿易-港口位於一鯤鯓與北線尾之間,是17世紀從臺灣海峽進入台江內海一帶的重要通道,是大員地區主要的港口。港口內側經常停泊著大的商船,但是也有許多小船及舢舨船,會將貨物運載到大船上。
荷蘭人聚落-熱蘭遮城座落在台江內海內西南側的一鯤鯓沙洲上,是荷蘭東印度公司在台灣的辦事中心以及戰爭用的堡壘。熱蘭遮城在日治時期經過大幅的整修,成為今日的樣貌,後來稱為安平古堡。
日本人聚落根據西洋水手的紀載,臺灣的日本人聚落坐落於北線尾北側,是一規模至少為150人的聚落,提供走私貿易與朱印船貿易的日本商人與海盜基地。
赤崁地區位於台江內海東側,赤崁為原住民語,荷蘭人習慣稱這裡為普羅民遮(Provientia),是嘉南平原的一部分,主要以耕地與原始森林為主。
鹿耳門鹿耳門是個介於北線尾與北方沙洲之間的水道,連通台江內海與臺灣海峽,雖然水面寬,但是水面底下高低不一、有許多暗沙,能夠允許船隻通過的部分其實很窄,只有在漲潮時能夠勉強...